Keep Pet >> Sällskapsdjur >  >> hundar >> Beteende

DNA-testning för blandrashundar

[Uppdaterad 10 januari 2019]

Sekvenseringen av hundgenomet, som genomfördes som ett offentligt forskningsprojekt 2004, öppnade slussarna för oändliga möjligheter för genetisk testning av hundar. Den heliga graalen för många forskare som är engagerade i detta arbete är förståelsen av, och i slutändan, elimineringen av ärftliga hundsjukdomar. För många hundägare är dock det mest spännande resultatet av detta seriösa arbete möjligheten att de kan lära sig exakt vilka raser deras hundar är gjorda av.

Även om det redan finns flera kommersiella företag som erbjuder produkter som utger sig för att kunna göra just det, är vår bedömning av rasidentifieringstesterna att resultaten kan vara lika blandade som de hundar de försöker förklara. Testresultaten kan vara nästan lika varierande, intressanta och njutbara som våra blandrasvänner, men det verkar som att de, åtminstone just nu, kanske inte helt kan tillfredsställa frågan om din mutts härkomst. Testerna blir dock bättre för varje dag! Och i takt med att förståelsen av DNA, storleken på provdatabaserna och datorernas kraft växer, är det troligt att testerna någon gång verkligen kommer att leva upp till den marknadsföringshype som för närvarande används för att sälja dem.

DNA-testning för blandrashundar

Hundrastester:en historia

Det första DNA-testet för blandraser föddes i laboratoriet hos Elaine A. Ostrander, Ph.D., och Leonid Krugylak, Ph.D., när de var på Fred Hutchinson Cancer Research Center i Seattle. Drs. Ostrander och Krugylak letade efter genetiska likheter bland renrasiga hundar erkända av American Kennel Club (AKC). Ett mål var att upptäcka de gener som är ansvariga för sjukdomar som är vanliga för både hundar och människor, inklusive flera typer av cancer. De studerade också släktskapet mellan cirka 100 av de AKC-erkända raserna; detta ledde till upptäckten att den genetiska variationen mellan hundraser är mycket större än variationen inom raserna. Som jämförelse är genetisk variation mellan mänskliga populationer cirka 5,4 procent; Hos hundar, upptäckte de, uppskattas variationen mellan raserna till 27,5 procent.

2005 undertecknade Ostrander och Krugylak ett kommersialiseringsavtal med Mars Veterinary™, en nyskapad division av mäktiga Mars, Incorporated (ja, tänk på godis, tuggummi, husdjursfoder och andra livsmedel), licensierande tekniken de utvecklat för användning i rasen identifiering.

Mars Veterinary var inte ensam i kapplöpningen att marknadsföra en rasidentifieringsprodukt. Forskare vid MMI Genomics Inc. (MMIG) studerade också hund-DNA. Faktum är att MMIG tillhandahöll identitets- och föräldraskapsverifieringstjänster för AKC, United Kennel Club (UKC), Professional Kennel Club (PKC) och ett antal andra hundregister och rasklubbar. MMIG var ursprungligen en division av Celera och ledde det privata försöket att sekvensera hundens genom. Det var också den första som kommersiellt marknadsförde ett rasidentifieringstest i mars 2007. MMIG kallade sin produkt för Canine Heritage™-rastestet. När den gjorde sin kommersiella debut kunde testet potentiellt identifiera endast 38 raser; testet ("XL") uppgraderades i mitten av 2008 för att identifiera mer än 100 raser.

DNA-testning för blandrashundar

Mars Veterinary lanserade sitt test bara några månader senare, i september 2007, som Mars Veterinary Wisdom Panel™ MX-test.

Hur fungerar hund-DNA-tester?

Varje företag främjar sina tester genom att säga att de är ett bra sätt för blandrashundägaren att lära sig om hans eller hennes hund kan vara mottaglig för en viss genetiskt kopplad sjukdom om hunden har raser som är kända för att ärva vissa tillstånd. De säger också att testerna hjälper till med träning, genom att ge ägaren insikt i hundens beteende; anledningen till att hunden agerar som den gör kan förklaras av hans bakgrund. I slutändan erkänner dock företagsrepresentanter att majoriteten av deras kunder köper testerna helt enkelt av nyfikenhet och för att det är roligt att göra.

DNA-testerna vi tittade på hämtar deras databaser från de mer än 160 raser som erkänns av AKC, och tar endast upp de raser som finns i Nordamerika. Över hela världen uppskattas det att det finns mer än 300 hundraser.

Testerna använder genetiska verktyg som kallas "markörer" för att definiera begreppet hundras. En genetisk markör är en position i genomet där det finns variation i sekvensen som ärvs, enligt reglerna för klassisk genetik. Två vanliga typer av markörer är mikrosatelliter och singelnukleotidpolymorfismer (SNP).

Varje företag har självständigt utvecklat en uppsättning markörer som definierar raserna i sina databaser och använder sofistikerade datoralgoritmer för att matcha en given blandrashunds DNA till det i dess databas för att komma fram till den/de bästa rasmatchningen för honom. Analysen avgör hur nära, och i vilken utsträckning, blandrashundens genetiska mönster matchar de renrasiga.

Det finns två mycket betydande aktörer på den amerikanska marknaden (MMIG och Mars Veterinary) och ett fåtal som försöker skapa en större roll. EDP ​​BioTech Corp. är mycket nytt; ett fjärde företag, DNA Diagnostics Center Veterinary, lägger ut sitt arbete på underleverantörer till EDP BioTech Corp. Det finns minst ett test (Viaguard DNAffirm™) som erbjuds av ett kanadensiskt företag, Accu-Metrics Ltd., som vi inte utforskade.

Mars Veterinary Wisdom Panel™

Wisdom Panel MX var det enda DNA-testet för blandraser som krävde ett blodprov. Ursprungligen endast tillgängligt via veterinärer, testet är nu tillgängligt online direkt från Mars Veterinary, såväl som från veterinärer och utvalda återförsäljare av djurtillbehör. Den har en rekommenderad detaljhandel på $125, vilket inkluderar gratis frakt om den beställs direkt från Mars Veterinary. Ändå är en resa till din hunds veterinär fortfarande nödvändig för att ta blodprov, vilket innebär en extra kostnad för veterinärbesöket och proceduren, och eventuell stress för din hund om han inte älskar veterinärkontoret.

AKC erkänner 161 raser; Mars Veterinary-databasen innehåller 153 AKC-raser i sin databas, plus fyra raser som väntar på erkännande från AKC, för totalt 157 raser. För att utveckla sin databas skrev Wisdom Panel in mer än 13 000 hundar under testutvecklingen och slutförde mer än 19 miljoner genetiska marköranalyser. Mars Veterinarys databas är den största av alla tre företag vi undersökte, men dess test är också det dyraste.

Efter att ha extraherat DNA från blodprovet identifieras enstaka SNP - eller små variationer i DNA-smink -. Testet undersöker 321 poäng eller markörer där variationer finns, och försöker bilda rasspecifika mönster. En proprietär algoritm körs sedan på datan.

Angela Hughes, DVM, en veterinärgenetiker och konsult för Mars Veterinary, förklarar det med att datorn sedan "säger" när den tittar på DNA från en viss hund:"Om jag måste göra henne till en sak, vad skulle vara det bästa match? Om två, vad skulle hon matcha, sedan tre, så så vidare, upp till åtta. Resultatet är sedan en statistisk poäng för varje "träd" som programmet bygger om hur den hunden bäst matchar." Åtta är den magiska siffran eftersom Mars Veterinarys förtroendenivå är att gå tre generationer tillbaka (åtta farfarsföräldrar).

Företaget hävdar att testet bestämmer rassammansättningen med 90 procents noggrannhet, och definierar det som valideringstest som har resulterat i en genomsnittlig noggrannhet på 90 procent hos första generationens korsade hundar med känd härkomst (vår betoning).

Liksom med det konkurrerande Canine Heritage-testet, rapporteras Wisdom Panel-resultaten i tre kategorier, endast Mars Veterinary kallar dem Significant, Intermediate och Minor raser, grovt översatt till förälder, mor- och farförälder. För att en ras ska listas som Signifikant måste minst 50 procent av hundens DNA ha kommit från den rasen (dvs en av föräldrarna var renrasig eller möjligen var båda morföräldrarna av samma ras); Medel, minst 25 procent; och Mindre, minst 12,5 procent.

Mars Veterinary förväntar sig att om din hund visar en signifikant ras, kommer han sannolikt att visa vissa fysiska egenskaper och beteendeegenskaper från den rasen, om inte några av generna är recessiva. För Intermediate "kan" du se vissa fysiska egenskaper och beteendeegenskaper hos den rasen hos din hund, och för Minor är det osannolikt att rasens fysiska egenskaper är visuellt representerade hos hunden om inte några av generna är dominerande.

Företaget citerar en två till tre veckors vändning på testresultat; teststatus kan spåras online – och resultaten, när de är klara, skickas till kunden men är tillgängliga online tidigare. Den enda kontaktinformationen för företaget som erbjuds på hemsidan är en e-postadress; hur ohjälpsam det än är, själva webbplatsen erbjuder massor av information.

När vi hittade ett telefonnummer för att nå företaget var representanten som svarade måttligt hjälpsam, även om han var mer beredd att ta itu med någon som ringde för att diskutera sin hunds testresultat än med någon som letade efter djupgående information om företaget och dess produkter.

Se Wisdom Panels produkter här.

BioPet Vet Lab / PooPrints

Den senaste aktören på marknaden är DNA Ras ID-testet som erbjuds av BioPet Vet Lab, en division av EDP Biotech Corp. Själva BioPet Vet Lab skapades i slutet av 2007; dess DNA-test för hundar lanserades i början av 2008 genom onlineåterförsäljare. Förutom ras-ID-testet erbjuder BioPet även DNA-bevis-på-föräldraskapstestning, DNA-djur-ID och det mycket intressanta PooPrints™-programmet ("matcha röran genom DNA").

Företagets mål är att erbjuda ett bra, prisvärt test. Man hoppas kunna åstadkomma detta genom att begränsa antalet raser i sin databas till 63 – som företaget hävdar representerar "cirka 93 procent av hundens DNA som finns i USA enligt historiska trender i rasens popularitet" – och prissätta testet till 60 USD . Att lägga till ytterligare raser kräver att man lägger till fler markörer, vilket ökar kostnaderna; BioPet föreslår att det med största sannolikhet kommer att toppa sin databas på 65 till 70 raser. Även detta test använder en kindpinne för att samla in en hunds DNA.

Företaget säljer sina tester genom PetSmart, Pet Supermarket, andra återförsäljare och online-återförsäljare. Omgången för resultat är ungefär två veckor, och det verkar inte som att företaget har onlinespårningskapacitet för teststatus. De kommer att köra ett test på nytt på begäran, och erkänner möjligheten för mänskliga fel, men företagets talesman Meg Retinger rapporterade att även i de som de har kört igen, har de aldrig sett ett testresultat som var helt annorlunda vid den andra körningen. BioPets webbplats har en måttlig mängd information, och företagets talesperson var hjälpsam.

Nöjda konsumenter av DNA-tester för blandraser för hundar

Ruby, uppkallad efter sin korta röda kappa, fördes hem till Rosalie och Leonard Sanchez från Riverside, Kalifornien, av deras 15-åriga barnbarn, som fick henne från en dam som gav valpar från baksidan av en pickup. Damen berättade för deras barnbarn att valpen var en St. Bernard-blandning. Rosalie avfärdade snabbt hans ord och antog att han hittade på den delen av historien, eftersom Ruby inte såg ut som en St. Bernard.

Tidigt i år lärde hon sig om Canine Heritage-testet och var nyfiken på att veta mer om Rubys bakgrund. Hon och hennes man gissade att Ruby var en del av boxare. Deras veterinär höll med, på grund av Rubys stora tassar; hans gissning var Boxer/Great Dane eller Boxer/Mastiff.

När resultaten kom tillbaka, föll Rosalie på golvet; hennes barnbarn hade trots allt rätt! Testet visade Boxer och St. Bernard. Även om hon fortfarande inte kan komma över hur Ruby inte liknar en St. Bernard, säger Rosalie:"En blandrashund är som en chokladask. Du vet aldrig vad som finns på insidan.”

Dan McCarthys flickvän hittade Flora liggande bredvid en busshållplats, utmärglad och täckt av loppor. Deras veterinär trodde att Flora var en blandning av labrador och springer spaniel, men hon var liten och vägde 30 pund vid två års ålder. Andra personer gissade Border Collie och Jack Russell Terrier.

Dan, bosatt i Hollywood, Kalifornien, ville veta så mycket om Flora han kunde. "Jag vill veta vem hennes mamma och pappa var, var de är nu, och visa dem att Flora har växt upp till en fantastisk hund med ett fantastiskt liv", säger han. Förra sommaren beställde han Canine Heritage-testet. Resultaten visade att Floras föräldrar förmodligen inte var renrasiga - ingenting listat i primärkategorin, precis som Dan hade misstänkt. Den sekundära nivån rapporterade dock schäfer och cocker spaniel. Dan blev förvånad. "Spanieln förklarar varför hon är så liten, och herden förklarar varför hon är så smart!"

Kitty Cannon från Crystal Beach, Florida, och hennes man hade alltid spelat en gissningslek om deras hundras makeup. När de fick veta om DNA-tester 2008 tänkte Kitty:"Varför inte? Eftersom vi inte har råd att få Fox klonad, kanske vi genom att känna till hans raser i framtiden kan leta efter en annan fantastisk hund med hans egenskaper." De gissade att Fox var en del av Collie eller Sheltie. När deras Canine Heritage-resultat kom tillbaka blev de förvånade över att få Berner Sennenhund i kategorin sekundär och Chow Chow "In the Mix." Endast en högre varelse skulle säkert veta om resultaten är korrekta, säger Kitty, "men vi märker vissa likheter om var han fick sin pälsfärg, öronform och käklinje. Vi vet att de bröt formen med honom och att det aldrig kommer att bli en till.”

Evelyn Orenbuch, en veterinär från Philadelphia, beställde Mars Veterinary Wisdom Panel MX till sin räddningshund, Pia. "Jag ville veta om Pias beteende hade något att göra med de raser jag trodde att hon hade i sig. Vi gissade Border Collie, Whippet och...?” Resultaten matchade endast på de lägsta nivåerna, vilket avslöjade schäfer och ett par andra raser. Dr Orenbuch var något besviken, eftersom hon hade hoppats på att få mer information om Pias ursprung. Ändå säger hon att hon skulle rekommendera testet till kunder. "Att veta vilka raser som finns hos din hund hjälper dig att förstå hans känslomässiga och fysiska aspekter. Det kanske inte förändrar vad du gör med din hund eller hur du behandlar honom, men det kan hjälpa dig att förstå honom.”

Kritik och begränsningar för rastestning

Visdomspanelen (Mars Veterinärprodukt) har kritiserats eftersom det kräver en resa till en veterinär och en blodtagning. Detta ökar kostnaderna för att testa och kan stressa veterinäravre hundar. Kritiker antyder också att blodprover kan skadas under transporten till labbet.

Mars Veterinary försvarar sitt beslut att använda blod genom att förklara att DNA från ett blodprov är "guldstandarden" eftersom kvaliteten och kvantiteten av DNA som härrör är bättre än från en buckal (kind)-pinne. Mars Veterinarys Dr Hughes säger att DNA:t i blodet faktiskt är väldigt tåligt, och i själva verket måste labbet höja temperaturen på DNA:t till nästan kokande upprepade gånger under SNP-analyserna. Företaget använder också specialdesignade plaströr för att skydda blodslangen under transport.

Kindprover får sin egen kritik. Buccala svabbprover har en högre felfrekvens på grund av variation i ägarprovtagningen, som att inte samla in tillräckligt med celler. På grund av bakterier i hundars mun finns det också en potential för bakterietillväxt om proverna inte hanteras korrekt.

Sedan kommer det kritik från konsumenterna. Ett återkommande tema för missnöjda klienter är att resultaten från ett DNA-test misslyckades med att hitta en övervikt av någon speciell ras hos deras "mycket blandade blandras"-hundar. (Se avsnitten nedan.)

En annan har att göra med det faktum att vissa hundar inte ser ut som de raser som deras tester upptäckt. Det är svårt att må bra av ett resultat som inte bekräftar eller förklarar något om hundens fysiska utseende eller beteende – och företagens förklaringar till detta fenomen kan vara otillfredsställande.

Webbplatsen för Wisdom Panel säger:"Många delar av hundens genom kommer sannolikt att vara oobserverbara eller dolda med avseende på egenskapsbestämning. Detta kan hända för hur många egenskaper som helst. Enkelt uttryckt kan en blandrashund vara en blandning av tre eller fyra raser men har få egenskaper som är tydliga från en eller flera av dessa raser.”

MMIGs förklarar:"Canine Heritage Breed Test fungerar bara för de raser som har validerats. Om ditt husdjurs rassammansättning innehåller icke-validerade ras(er) kan testet identifiera ras(er) tidigare i din hunds härkomst. Detta kan orsaka identifiering av uppenbart osannolika raser för ditt husdjurs sammansättning." Hur giltiga är resultaten?

För att få lite perspektiv från en oberoende expert på hund-DNA, intervjuade vi Beth Wictum, chef för Veterinary Genetics Laboratory vid University of California-Davis School of Veterinary Medicine. Wictum har varit på universitetet i 30 år. Hon har deltagit i och bevittnat utvecklingen av vetenskapen som gör det möjligt att identifiera ett djur genom att studera dess vävnad; under hennes mandatperiod har "state of the art" gått från blodtypning till att sekvensera genomet.

Tillfrågad om att kommentera ID-tester av blandraser, betonade Wictum att testerna bara är lika bra som varje företags databas; det vill säga, om en ras inte är representerad i ett företags databas, kommer testet att identifiera den näst närmaste matchningen. Hon förklarar med att renrasiga hundar, särskilt registrerade renrasiga, har skötts intensivt och har en begränsad genetisk pool.

"De flesta raser har skapats genom intensivt urval under de senaste hundra åren, så det har inte funnits tillräckligt med tid för dem att divergera genom mutationer", säger hon. Skillnaderna mellan raser ligger i den selektiva aveln av uppfödare för morfologi (struktur) eller beteende. Därför skulle det ideala rastestet vara ett som tittar på de egenskaper som kännetecknar varje ras och gör dem unika.

"Fältet för hundgenetik är fortfarande ungt; hundgenomet sekvenserades bara för ungefär fem år sedan, säger hon. "Vi har precis börjat identifiera generna som är ansvariga för olika egenskaper."

Liksom många forskare inom detta område är Wictum exalterade över potentialen för att identifiera den genetiska grunden för olika sjukdomar. Hon säger att Veterinary Genetics Laboratory vid UC Davis och Bannasch Laboratory (även vid UC Davis) "identifierar den genetiska grunden för olika sjukdomar, som sedan kan erbjudas som tester till allmänheten. Om du vet vilka sjukdomar som kan uppstå kommer du att kunna få ditt husdjur att testa för att se om det bär på mutationen.”

Hennes råd angående DNA-testerna för blandraser? "Även om dessa tester kan indikera raser som bidrog till ditt husdjurs genetiska sammansättning, måste du inse att de inte är 100 procent korrekta - och jag tror inte att de gör anspråk på att vara det. Om du har pengarna att spendera och vill göra det bara för skojs skull, så fortsätt absolut och gör det.”

Vissa ägare säger att rastestning inte är värt det

Laura Pescador från Denver, Colorado, beställde Canine Heritage-testet för Misha, hennes "60-pund, svart och brun, fyrkantig näsa, korthårig, storörad, djupt bröstad, tvåögd mysterieblandning" i maj 2008 Laura kände att raskombinationen hon fick höra när hon adopterade Misha var osannolik (Australian Shepherd/Labrador Retriever); hon hoppades också få ett papper som sa att Misha inte var en pitbull-blandning, "Inte för att jag inte gillar dem utan på grund av min stads rasspecifika lagstiftning." Laura blev besviken över att få ett "ursäktsbrev" med resultat som säger att testet inte var avgörande! På hennes certifikat stod det "Otestad ras" bredvid "Primär" medan de andra två kategorierna var tomma.

Scamper, Monty och Rainey är tre blandrashundar som tillhör veterinären J.C. Burcham från Olathe, Kansas. I början av 2008 lämnade hon in blodprover för varje hund till Wisdom Panel-testet. Dr. Burcham var ganska säker på att Monty var "flera generationer av mutts som avlade till mutts" och hade få förväntningar på sina resultat. Hon kallar Scamper för en Jack Russell/Basenji/Beagle-blandning, så hon förväntade sig att se något sådant, eller till och med någon terrierras. Rainey hittades som en valp på landsbygden i Virginia, svältande ihjäl med två kullkamrater, som alla tre såg ut som Border Collies.

När resultaten kom in var Dr Burcham besviken. "Jag kände att det var totalt slöseri med pengar! Rainey är helt klart en del av Border Collie, och det var ungefär det enda pålitliga resultatet jag såg. Två av mina tre hundar visade sig vara "för komplexa" för att identifiera. Jag kunde ha berättat det! Det är därför jag betalade för testet." Raineys resultat visade "några" Border Collie; dock visade hon avlägsna spår av Briard, Cairn Terrier, Great Dane och Keeshond. Montys test avslöjade avlägsna spår av Alaskan Malamute, Beagle, Bearded Collie, Chow Chow och Smooth Fox Terrier, medan Scamper's visade spårmängder av Briard, Curly-Coated Retriever och Shetland Sheepdog.

Dr. Burchams främsta besvikelse var att se Briard i två av sina hundar, vilket var osannolikt, enligt hennes åsikt. Hon var också irriterad över att Scamper och Monty kallades "extremt komplexa blandrashundar." Med bara 10-15 procent av blandrashundar som faller i den kategorin (enligt Mars Veterinary), hur kunde hon ha två av dem?

Jag delade Dr. Burchams besvikelse med Dr. Hughes, Mars veterinärkonsult, och hon erbjöd sig att inte bara titta på, utan också göra om de tre testerna. Under året sedan Dr.
Burcham lämnade in proverna, ytterligare 23 raser har lagts till Mars Veterinary-databasen och dess algoritmer har modifierats. Företaget hade upptäckt att programmet bröt ner hundar i många små bitar, "förlorade skogen genom träden", vilket resulterade i några falska positiva resultat. Resultaten är nu vanligtvis ett mindre antal raser och potentiellt i större "mängder".

När Raineys test kördes igen dök inte Briard och Cairn Terrier upp; de hade med största sannolikhet varit falska positiva. Border Collie stötte upp till Significant (förälder) nivå, och Great Dane och Keeshound dök upp på mellannivå (morförälder). Montys resultat visade att Beagle och Chow flyttade till mellannivån (farföräldern); de andra raserna var fortfarande uppenbara men kunde inte kallas med tillförsikt, så de var sannolikt falska positiva i det första testet.

Scampers nya resultat avslöjade fortfarande en "mycket blandad hund." Curly-Coated Retriever flyttade till mellannivå (farförälder) och Golden Retriever dök upp på minornivå. Briard och Sheltie var potentiellt en del av hennes avlägsna historia eller falska positiva resultat. Anatolian Shepherd och Australian Cattle Dog upptäcktes också, som Dr. Hughes ansåg var mer sannolikt än Briard och Sheltie.

Nancy Kerns väger in

Naturligtvis när författaren Lisa Rodier föreslog idén att skriva en artikel om identifieringstesterna för blandraser, [ ville jag få min blandrashund, Otto, testad – du vet, bara för journalistikens skull! Men vilket test ska vi beställa, från vilket företag? Vi bestämde oss snabbt för att beställa den mest omfattande produkten från vart och ett av de två branschledande företagen och jämföra resultaten.

Otto hade ett veterinärbesök på väg, som jag använde som ett tillfälle att få hans blod uttaget för Mars Veterinary Wisdom Panel. Vi följde det normala protokollet:Jag betalade veterinären för blodtagningen och testet; hans personal skickade provet till labbet och gav mig ett test-ID-nummer så att jag kunde kontrollera testets framsteg med hjälp av Wisdom Panels webbplats.

Följande dag tog jag med mig Otto till PETCO för att köpa ett testkit för MMIGs Canine Heritage "XL"-test (detta företag har sedan köpts av Wisdom Panel). Personalen på PETCOs groomingavdelning har utbildats av MMIG för att samla in kindsvabbar. Efter resan till veterinären föregående dag var Otto nervös, så jag samlade ihop kindpinnen själv (men bad en PETCO-anställd att posera med provet och dess postkuvert, du vet, för vetenskapen).

DNA-testsuspense

Att vänta på resultat var plågsamt 7, särskilt eftersom Canine Heritage skickade ett e-postmeddelande till mig dagen efter att jag postade kindpinnen, och bekräftade att det mottagits i dess laboratorium i Davis, Kalifornien (jag bor cirka 11 mil från Davis). Detta gav mig tanken att jag kanske skulle få resultat snart – men det tog hela sju veckor att få dem med posten! (MMIG säger att resultaten borde komma inom sex till åtta veckor; det var bara förväntan som fick denna väntan att verka oändlig. Plus det faktum att du inte kan få resultaten online.) Jag kollade på webbplatsen för resultaten från Wisdom Panel varje dag. Bara tre veckor efter att Otto hade låtit ta blod, såg jag att resultaten var klara och jag kunde ladda ner Adobe Acrobat-filen som innehöll dem.

Så? Vad är Breed is Otto?

Resultaten från Wisdom Panel sa:"Analysen avslöjade att Otto är en ganska blandad hund och vi har inte hittat bevis på en renrasig förälder eller morförälder." (Jag tror att jag visste det!) Det fanns inga resultat på nivån "Betydande" eller "Mellanliggande". Men på "Minor"-nivån dök dessa fyra raser upp:schäferhund, *Basenji, *Chow Chow och *Border Collie. Asteriskerna indikerade "Mindre mängd upptäckt med låg konfidens. Dessa resultat ingår inte i noggrannhetsberäkningar.” (Jag:"Basenji?!")

Resultaten från Canine Heritage visade ingenting i kategorin "Primär", Chow Chow i kategorin "Sekundär" och pudel och border collie "i blandningen." (Jag:"PUDEL?!")

Mina förväntningar

Jag skulle ha gissat att Otto hade någon schäferhund i sig, och jag förväntade mig till och med lite Chow Chow. Han har definitivt en GSD-typ av svans och hans öron är väldigt Chow. När han är genomblöt och håret är nedslipat ser hans kroppsform lite ut som en Golden Retriever. Och jag var säker på att det måste finnas någon terrierras i honom. Hur förklarar du annars det där luddiga ansiktet?

Skyddet som jag adopterade honom från gissade att han var Airedale och Border Terrier. (Jag ger dem en paus; han var bara omkring fem månader och liten när de fick honom.) Även om den här rasen inte förekommer i vare sig Canine Heritage eller Wisdom Panel-databasen, var författaren Lisa Rodier på jakt efter en Picardy Shepherd (Berger Picard) resultat; hon tror att han är en ringare för Winn-Dixie-hunden. Ingen gissade Border Collie, Pudel eller Basenji.

Varför fungerade inte DNA-testerna?

Hur kan de två företagen ha så olika resultat för Otto?

Vi bad Theresa Brady, taleskvinna för MMIG, att ta upp denna fråga. Hon svarade, "Varje företag utvecklade sitt test oberoende, så det finns ett antal faktorer som kan resultera i att olika raser erkänns hos en viss hund. Under forskningsfasen ska varje företag identifiera en uppsättning DNA-markörer som kännetecknar skillnader från ras till ras. Sedan måste dessa markörer karakteriseras i en uppsättning hundar som representerar de rena raserna.

"Inte bara är dessa markörer olika mellan företag, men antalet och källan till renrasiga hundar är olika. Inget företag kan testa varje renrasig hund som representerar en ras, och varje företag kommer att ha utvecklat programvara som används för att jämföra dessa genetiska markörer mellan raser.

"Vissa raser är dock nära besläktade eftersom de utvecklades från korsningen av äldre, mer etablerade raser. Till exempel utvecklades Bostonterrier från korsningen av den engelska bulldoggen och den engelska vita terriern. So, depending on the software program, the markers established for the purebreds and the population of breeds in each company’s database, the same dog may test ‘Boston Terrier’ with one company and ‘English Bulldog’ with another.

“Some breeds are related because they arose from a common lineage, such as many of those breeds developed from Asia. Early on, we (MMIG) recognized that the Chow Chow, the Akita, the Siberian Husky, the Chinese Shar-Pei, and even the Shih-Tzu can cluster together as one general breed type so we developed an enhanced program and analysis procedure to split these apart. Thus it is not surprising that the companies may report slightly different results, especially for the breeds that have just a small representation in the mixed breed pet.”

Addressing any results that appear in the “Secondary” section of a report (where they detected Chow Chow in Otto), the MMIG (Canine Heritage) results packet says, “This category reports breeds that might be easily recognizable within your dog. While these breeds may or may not have a strong influence on your pet, each breed listed makes up less than the majority of your dog’s DNA.”

Addressing results that appear in the “In the Mix” section of a report (where they detected Poodle and Border Collie in Otto), the Canine Heritage packet says, “This final category identifies breeds that have the least amount of influence on your pet’s composition. They still appear, at low and measurable amounts, in your pet’s DNA. If your pet’s results only identify breeds in this category, it is possible your pet is composed of so many breeds only small influences from each breed can be detected.”

The Mars Veterinary (Wisdom Panel) results packet explains, “Because of the complexity of genetics and the passing on of dominant and recessive genes from generation to generation, every trait from the breeds we found may not always be visually apparent. It is important to spend time closely observing Otto’s appearance and personality. Think about which of Otto’s traits may reflect a combination of the breeds detected, and which seem to reflect just one of the individual breeds.”

Our Opinion on Breed Testing

I have to say that I found the whole exercise very interesting, but not necessarily worth the cost. Given that the results for my very mixed-breed dog were so weak, the idea that they might help me anticipate certain health or behavior problems linked to the breeds found is not very compelling. But I doubt that’s why most people order the tests; I think most of us are just curious.

Having spent so much time examining and admiring the technological achievements that went into the development of these DNA tests, Lisa Rodier was afraid I would pooh-pooh the science behind these tests because I was so skeptical of the breeds detected in Otto’s lineage. It’s not that; I trust the science. I believe there are traces of these breeds (and many others) in Otto. It’s just that I already knew he was a very mixed dog, just from a (free!) look at him. And if he wasn’t such a mixed bag – if he looked a lot like one particular breed, I’d probably be satisfied with the idea that he was mostly that breed; I wouldn’t spend $100-plus to confirm it.

That said, I must admit I will be interested to see how the results might change in a few years, after these companies put thousands and thousands more dogs into their databases. Which breeds will “fall off” of Otto’s results as meaningless “background noise”? Will the Picardy Shepherd be added? It could still develop that Otto is a limp-eared Picardy who fell out of a French tourist’s car somewhere in the Northern California wine country…We’ll check back with these companies in a few years, and let you know.

– Nancy Kerns

Dog DNA Testing FAQs

Canine mixed breed tests seem to be a very emotional topic. Those who have used the tests and have gotten the results they expected tend to be proponents, while those who received weak results or results that didn’t seem to square with the dog’s appearance tend to regret the purchase. But does that mean the tests don’t work? Here’s a stab at trying to explain some of what might be going on.

Breed results are reported in levels; Why is my dog only getting “minor” or “trace” breeds and no strong hits?

Dr. Hughes explained that most likely the dog’s parents and grandparents were themselves mixed breed, and a portion of the dog’s ancestry can be mixed beyond three generations which, for Mars Veterinary, is the extent of the company’s confidence. There is also the possibility that a breed is not covered in the database (for example, none of the tests’ databases include Rat Terrier) so the test will look for the most closely related breed.

My dog looks like X, but the test says she’s Y…

Dr. Hughes explains that we want to associate a particular trait with one breed, but in actuality, it could be coming from a number of breeds. And when we move across breeds, combinations of genes can create very unusual outcomes.

One way she looks at the issue is first looking at a dog’s traits, defining what genes are necessary to get those traits, and then asking whether we can get those genes in a particular breed? For example, the merle color pattern, very common in Australian Shepherds, comes from a single gene, and a dog need only have one copy of that gene to exhibit that color pattern, And guess what? Dachshunds, Chihuahuas, and Great Danes can all provide that gene.

Black and tan coats are commonly associated with Rottweilers and Dobermans. But Chihuahuas, Cocker Spaniels, Dachshunds, and Poodles all carry this gene mutation. But in this case, it is recessive, so two copies must come together for

us to actually see that color pattern.

Meg Retinger of BioPet also points out that in some very mixed dogs, you might only see very subtle traits, such as the shape of the ear or the eyes. Her son’s dog tested as showing Beagle, yet she looks very much like a Labrador. When she howls, however, she sounds like pure Beagle!

My dog is a Labradoodle (Labrador Retriever-Poodle cross), so why doesn’t the test say she’s a 50/50 mix?

We let Theresa Brady of MMIG address this, as she herself owns a Labradoodle. When she tested her dog using the Canine Heritage test, the results showed that Poodle was a Secondary breed, with Labrador Retriever “In the Mix.”

She explains, “You should know that my dog came from a breeder who claimed that the dog was seventh generation Labradoodle, which means that neither of her parents was a purebred (purebred Poodle or Retriever) and neither of their parents were purebred and so on. It makes sense, then, that she had nothing show up in Primary.” When I asked why the Poodle was Secondary, but not the Retriever, her guess was that the breeder probably crossed back more Poodle, looking for a more hypoallergenic coat. Dr. Hughes adds, “When breeding Labradoodle to Labradoodle, the “amount’ of Lab or Poodle genes passed down is random chance (think of a Pachinko machine). Testing the dog’s littermates may show very different proportions of each of these breeds. That being said, some ‘Labradoodle’ breeders are back-crossing Labradoodles to Poodles to change the size or coat of the dogs. I have seen some really strange looking Labradoodles!”

How can dog DNA tests get better?

Increasing the size of the database, increasing the number of markers, and overall innovations in technology will see the tests become better tools. Also, as research continues on canine genetics, a better understanding of genes and how they relate to various breed traits will play a role in making a better test.

Lisa Rodier lives in Alpharetta, Georgia, with her husband and two Bouviers.