Australiska herdar kan drabbas av följande (men inte begränsat till) hälsotillstånd och sjukdomar, av vilka några är ärftliga. De är inte alla hälsotillstånd och sjukdomar med hög risk för australiensiska herdar. Vissa av dem är miljösjukdomar så de kan lätt undvikas genom att ge australiska herdar ordentlig vård och uppmärksamhet.