Belgisk malinois kan drabbas av följande (men inte begränsat till) hälsotillstånd och sjukdomar, av vilka några är ärftliga. De är inte alla hälsotillstånd och sjukdomar med hög risk för belgiska malinois. Vissa av dem är miljösjukdomar så de kan lätt undvikas genom att ge belgiska malinois ordentlig vård och uppmärksamhet.