Stora pyrenéer kan påverkas av följande (men inte begränsat till) hälsotillstånd och sjukdomar, av vilka några är ärftliga. De är inte alla hälsotillstånd och sjukdomar med hög risk för de stora pyrenéerna. Vissa av dem är miljösjukdomar så de kan lätt undvikas genom att ge Great pyrenéerna ordentlig vård och uppmärksamhet.
