Maltesiska Shih Tzus kan påverkas av följande (men inte begränsat till) hälsotillstånd och sjukdomar, av vilka några är ärftliga. De är inte alla hälsotillstånd och sjukdomar med hög risk för maltesiska Shih Tzus. Vissa av dem är miljösjukdomar så de kan lätt undvikas genom att ge maltesiska Shih Tzus ordentlig vård och uppmärksamhet.
