Maltipoos kan påverkas av följande (men inte begränsat till) hälsotillstånd och sjukdomar, av vilka några är ärftliga. De är inte alla högriskhälsotillstånd och sjukdomar för maltipoos. Vissa av dem är miljösjukdomar så de kan lätt undvikas genom att ge Maltipoos ordentlig vård och uppmärksamhet.