Shetland sheepdogs kan drabbas av följande (men inte begränsat till) hälsotillstånd och sjukdomar, av vilka några är ärftliga. De är inte alla hälsotillstånd och sjukdomar med hög risk för Shetland sheepdogs. Vissa av dem är miljösjukdomar så de kan lätt undvikas genom att ge shetlands sheepdogs ordentlig vård och uppmärksamhet.