Shiba inus kan påverkas av följande (men inte begränsat till) hälsotillstånd och sjukdomar, av vilka några är ärftliga. De är inte alla hälsotillstånd och sjukdomar med hög risk för Shiba inus. Vissa av dem är miljösjukdomar så de kan lätt undvikas genom att ge Shiba inus ordentlig vård och omsorg.
