Keep Pet >> Sällskapsdjur >  >> hundar >> Beteende

DNA-tester för hund:blandade resultat

En underbar vårdag i Montana var jag på väg tillbaka från en lek i bergen med mina tre hundar när vi klev ut ur skogen på en äng, fylld av sångfåglar och en massa kor som betade fridfullt. Mina följeslagare upptäckte snabbt, till sin absoluta förtjusning, färska, läckra kopajer.

Det slog mig dock att jag inte kände till MDR1-statusen (multi-drug resistens gen) för den nyaste medlemmen av mitt tre-hundsbesättning, Hap. MDR1 är en genetisk predisposition för biverkningar av mer än ett dussin vanliga veterinärmedicinska läkemedel, och genen finns främst i vallningsraser. Hap ser mest ut att vara Border Collie med kanske, bara kanske, en nypa Australian Shepherd, så att ha denna predisposition kan sätta honom i fara i den här situationen. Kor får ofta ivermektin som ett antiparasitiskt medel, och läkemedlet kan hittas kort därefter i deras spillning; att äta denna spillning kan orsaka en dödlig reaktion hos en hund med MDR1-mutationen. Så jag lade ett moratorium på eftermiddagens pajprov, till min besättnings bestörtning, och iväg promenerade vi in ​​i solnedgången.

När vi kom hem och jag började leta efter information om MDR1-tester, fick jag veta att många av de genetiska testerna för rastypning nu även inkluderar genetiska hälsoundersökningar, inklusive testning för MDR1-mutationen. Jag tänkte, varför inte lösa mysteriet med Haps rasblandning och samtidigt få hälsoinformation? Det lät kul!

DNA-tester för hund:blandade resultat

Hur fungerar hund-DNA-tester?

Medan några av de tidiga identifieringstesterna för blandraser använde ett blodprov, extraherar alla produkter på marknaden idag DNA från celler som svabbas av hundens ägare från insidan av hundens kind. Pinnen försluts i en behållare som tillhandahålls av företaget och skickas till företagets labb. Där extraherar tekniker din hunds DNA från pinnen och använder datorer för att identifiera och jämföra specifika bitar av den med bitar tagna från hundar av känd härstamning.

Genomet hos en hund innehåller cirka 2,5 miljarder nukleotider (byggstenarna i DNA); forskare fokuserar på "bara" omkring 200 000 av dessa individuella gener – eller snarare, mikrosatelliter eller repeterande sekvenser av DNA som kallas enkelnukleotidpolymorfismer (SNPs, uttalas "snips") som bildar signaturer som är speciella för olika raser.

Forskare måste ha tillräckligt med SNP från tillräckligt många renrasiga representanter för varje ras för att ha ett adekvat utbud av SNP som de kan jämföra din hunds SNP med. Ju större företagets databas med prover från renrasiga hundar, desto bättre. När ett företag helt misslyckas med att föreslå förfäder till kandidatraser som är mycket troliga, är det troligt att det saknar tillräckligt många raser i sina databanker för att hitta bra matchningar för din hunds SNP.

Företag som erbjuder blandras DNA-tester

DNA My Dog

DNA Min hund Identifiering av hundraser , $69. Identifiering av 92 raser.
DNA My Dog Breed Test plus Wolf-Coyote Hybrid Test , $89.
DNA rasidentifieringstest plus fullständig genetisk screening , $189. Hälsoscreening identifierar mer än 100 sjukdomar.

Embark Veterinary, Inc.

Dna-test för hundar ombord , $199. Identifiering av mer än 175 raser och mer än 160 sjukdomar. "Vi testar 20 gånger mer av din hunds gener än andra hund-DNA-tester."

Visdomspanel

Detektion av hundraser , $85. Identifiering för 250+ raser, plus MDR1 och Exercise-induced Collapse (EIC) screening för drog- och träningskänslighet.
Canine Breed Plus Disease Detection , $150. Identifiering för 250+ raser, plus MDR1 och Exercise-induced Collapse (EIC) screening, plus avancerad hälsoscreening för mer än 150 genetiska hälsotillstånd.

När din hunds utseende bedrar

Som sagt, när hundar av olika härkomst förökar sig, kan de resulterande valparna visuellt likna andra raser helt - men de genetiska signaturerna som ärvts från deras föräldrar är mer talande än det mest hundkunniga ögat. Ta Clara till exempel. Clara är en skyddsräddningshund, adopterad som ung vuxen, som antogs mestadels vara en labrador, med något mer medelstort i mixen. Hennes ägare, Gianna och Kip Savoie, gissade att hon hade en vallningsras någonstans i sin härstamning, med tanke på många Border Collie-liknande beteendeegenskaper som de hade sett.

DNA-tester för hund:blandade resultat

De skickade en pinne av hennes kind till Embark för analys. Det som kom tillbaka var mest vad de hade misstänkt:Labrador Retriever, en skvätt Border Collie, men med några mindre överraskningar och en väldigt stor. Denna korthåriga svarta hund förklarades faktiskt vara mer Golden Retriever (38 procent!) än något annat.

Baserat på den skarpaste visuella bedömningen kan detta verka som ett fel, men det är i själva verket mycket genomförbart.

Golden Retrievers bär på en svart gen som uttrycks i deras näsa, kuddarna på deras fötter, deras glamorösa tjocka, svarta eyeliner, men inte i pälsen. Det svarta blockeras av den gula genen, som är recessiv, liksom deras karakteristiska lyxiga långa lås. En Golden Retriever avlad till en hund som saknar gener för gul färg och lång päls, som en svart labrador, skulle därför resultera i en svart hund med kort päls – en hund som liknar Clara mycket.

Några förbryllande hund-DNA-resultat...

I den mer komiska delen av spektrumet förklarades Hap, min glada, humliga, flygande border collie/mystery-breed-korsning av Wisdom Panel till 88 procent Border Collie och 12 procent – ​​redo för detta? – Boston Terrier! Jag har aldrig ens sett en Boston Terrier i Montana under mina 20 år som bor här genomsyrad av allt som har med hund att göra, så det var mycket osannolikt.

Eftersom jag bor på ett lantligt, ranch-tungt område och härbärget från vilket jag skaffade den här killen är litet och mer likt en vallhundsräddning än ett allmänt skydd med öppen dörr, kämpade jag för att föreställa mig var Boston Terrier-gener möjligen kunde komma ifrån . Å andra sidan är Hap definitivt den mest lekfulla, sällskapliga hund jag har känt och dessa egenskaper passar personlighetstypen hos de Bostonterrier jag har träffat, så kanske. Kanske var det en Boston Casanova som gick igenom som besökte en ranch vid precis rätt tidpunkt. Konstiga saker kan hända.

Men ibland testar resultaten gränserna för godtrogenhet. Ta, som ett exempel, resultaten som returnerades av DNA My Dog från ett prov från Otto, en hund av mycket blandad ras som tillhör WDJ:s redaktör, Nancy Kerns. Otto har testats av flera företag (se "Ottos resultat" nedan). De två företagen med de största rasdatabaserna gav ganska likartade resultat. Men DNA My Dog, ett mycket mindre företag, gav resultat som inte bara var helt olik resultaten från de två större företagen, utan också otroligt osannolika. Det är högst osannolikt att de föreslagna raserna finns i Ottos geografiska ursprungsområde, och ännu mindre sannolikt att de finns i den identifierade kombinationen.

När hund-DNA-resultat inte är vettiga

Företagen som erbjuder den här tjänsten har några standardförklaringar till resultat som inte verkar vara vettiga.

Inget av företagen skulle erkänna att deras referensdatabaser är av en otillräcklig storlek för att exakt identifiera SNP från din hund – men de kanske tyder på att detta kan vara sant för deras konkurrenter.

Alla företag kommer att vara snabba med att förklara att det finns hundratusentals gener som är ansvariga för en hunds utseende, och att många raskombinationer resulterar i hundar som ser väldigt annorlunda ut än vad man kan förvänta sig av den blandningen av raser.

Dessutom kombineras gener i blandraser inte alltid på samma sätt inom alla kullkamrater, så storlek och fysiska och beteendemässiga egenskaper i samma kull av valpar kan och varierar ofta, ibland vilt.

De förklarar också att komplexiteten i din hunds blandning kommer att påverka noggrannheten i resultaten. Första generationens korsningar mellan två renrasiga föräldrar är relativt lätta att identifiera, men hundar som inte har några renrasiga förfäder inom flera generationer är mycket svårare att identifiera med stor säkerhet, eftersom längden på de ärvda SNP:er som är unika för renrasiga hundar blir mycket kortare för varje generation av blandrasavkomma.

Problem med identifiering kan också uppstå när det finns mycket avvikelser inom en specifik rastyp, som i fallet med Australian Shepherds och Border Collies, där man har fältuppfödda linjer och show-uppfödda linjer. De genetiska signaturerna i företagens databaser överensstämmer vanligtvis med utställningsuppfödda linjer, så fältuppfödda Aussies och BCs kan till och med bli tilldelade en annan ras helt och hållet.

Både Embark och Wisdom Panel gör det enkelt för konsumenter att kontakta dem och ställa frågor om deras hundars resultat. Jag ringde och bad en representant från Wisdom Panel att granska Haps resultat med mig och fick veta att det statistiska förtroendet för Boston Terrier-fyndet var marginellt, vilket betyder att det är stor sannolikhet att detta resultat inte är korrekt. Hap kan ha 12 procent av något som inte finns representerat i Wisdom Panel-databasen (som fältuppfödda australiensiska herdar), men eftersom denna unika signatur för närvarande inte finns i databasen, tilldelades han rasen med närmast matchande genetiska signatur. Jag fick veta att uppdateringar kommer att göras av Haps rapport när ny information läggs till i databasen.

Vilket hund-DNA-test är bäst?

Av de tillgängliga varumärkena verkar Embark och Wisdom Panel vara de mest transparenta om sina metoder och om informationen som finns tillgänglig i deras databaser. De gör båda ofta uppdateringar av sina produkter, samtidigt som de är tillgängliga för att svara på konsumentfrågor. Detta gör att de båda stiger till toppen i min bok. Observera dock att det grundläggande Wisdom Panel 4.0 Breed Detection-testet kostar mindre än halva priset för Embark-testet.

Andra företag, som DNA My Dog, har en relativt liten databas med 92 raser, mycket knapp information tillgänglig om deras metodik, och jag hade svårt att ens hitta kontaktinformation för att ställa frågor.

Medan kommersiell genetisk rastypning fortfarande utvecklas, är det intressant och löjligt roligt, vilket är värt något. Fler företag erbjuder också genetiska hälsoundersökningar, vilket kan visa sig vara användbart för den långsiktiga hälsovården för din hund. Mycket av det kanske inte är tillämpligt på just din fyrbenta vän, så innan du lägger ut pengarna bör du rådfråga din veterinär för att ta reda på vad hon eller han rekommenderar.

Ottos resultat

Ottos resultat har förändrats under de senaste åtta åren, med den osannolika Basenji som försvinner och en mobbar ras och australiensisk nöthund dyker upp i mixen. Observera att resultaten från de två ledande testleverantörerna av blandraser är ganska lika - och att resultaten från det minsta företaget som erbjuder denna tjänst gränsar till fantasi. (De här raserna är mycket ovanliga i Ottos ursprungsområde och skulle vara ännu mer ovanliga hos samma hund.)

2009:Wisdom Panel

Schäfer hund
Basenji
Chow Chow
Border Collie

2016:DNA My Dog

Nivå 3 (20%-36%):Collie, Nova Scotia Duck Tolling Retriever
Nivå 4 (10%-20%):Engelsk setter, norsk älghund

2016:Wisdom Panel

12,5 % amerikansk Staffordshire Terrier
12,5 % australisk boskapshund
12,5% Border Collie
12,5 % Chow Chow
12,5 % schäferhund
37,5 % (blandat)

2018:Ombordstigning

21,3 % amerikansk Pit Bull Terrier
14,1 % australisk boskapshund
13,2 % schäferhund
12,3 % Chow Chow
10,3 % labrador retriever
8,0% Border Collie
4,3% Rottweiler
16,5 % ("Supermutt")

Kathryn Socie-Dunning bor med sin man och tre hundar i Montana.