Det är ofta svårt att bestämma könet på en sällskapssköldpadda, speciellt om du inte köpt den från en uppfödare som kläckt dem från kontrollerade temperaturmiljöer. Temperaturen under ägginkubationen är det som avgör om ett embryo ska bli en hane eller hona; kallare inkubationstemperaturer producerar hanar och honor utvecklas i varmare temperaturer.
Tack och lov finns det vissa typer av sköldpaddor som gör det lättare än andra att skilja en hane från en hona utan att veta deras inkubationstemperatur. Rödörade reglage uppvisar till exempel sexuell dimorfism och har tydliga skillnader i storlek och utseende mellan könen.
Storleksskillnaderna mellan de flesta manliga och kvinnliga sköldpaddor kanske inte är uppenbara förrän sköldpaddorna når sexuell mognad (och kosten kan också spela en roll för storleken på en sköldpadda). För manliga rödörade glidare handlar sexuell mognad ungefär när de når 4 tum i längd (och vid ungefär två till fem år gamla). Honor är könsmogna när de når 6 till 7 tum långa (vilket kan ta fem till sju år). Honor kommer att växa sig större än hanar i rödörade glidare och många andra sköldpaddor, men storleksskillnaden mellan hanar och honor varierar beroende på art. Till exempel, hos sulcata-sköldpaddor kan honorna nå 100 pund och hanarna kan växa till 200 pund eller mer. Hos havssköldpaddor kan både hanen och honan växa till samma storlek. För att på ett tillförlitligt sätt använda skalstorleken som en faktor för att bestämma kön på en sköldpadda måste sköldpaddan ha nått sin vuxenstorlek.
Botten av en sköldpaddas skal (kallad plastron) används också som en indikator för att bestämma kön hos sköldpaddor. Manliga sköldpaddor har en konkav (böjd) plastron medan honor har en platt. Dessa former gör att sköldpaddor av hanar lättare kan montera sig på en hona under parning, och de ger honorna mer utrymme att hålla ägg internt.
Sköldpaddshonor har ofta korta och stubbiga klor på framfötterna. Hanar (och i synnerhet rödörade glidare och andra vattenlevande sköldpaddor) har mycket längre klor på sina framfötter än honor. Detta beror på att hanar använder sina klor när de försöker uppvakta honor för att häcka. Under parningen kommer hanarna också att ta tag i honans övre skal genom att använda sina långa klor.
Det vanligaste sättet att bestämma kön hos en sköldpadda är att titta på längden på dess svans. Sköldpaddor av honkön har korta och smala svansar medan hanar har långa, tjocka svansar, med deras ventil (cloaca) placerad närmare slutet av sköldpaddan. svans jämfört med en hona. Det är naturligtvis enklast att bestämma en sköldpaddas kön när man tittar på svanslängden om man har flera sköldpaddor av båda könen att jämföra.
Alla reglage med röda öron har övervägande gröna kroppar fyllda med ljusgula streck, vilket inte hjälper till att skilja hanar från honor. Men andra färgindikatorer kan. Plastronen är gul med ojämna mörka markeringar som paras ihop medan svansen, benen och huvudet är gröna med tjocka gula ränder. När rödörade reglage blir äldre, övergår många till en mörk, nästan svart färg och kan skymma några eller alla av sina gula markeringar. Denna mörkare färg är vanligare hos manliga rödörade reglage.
Utsmyckade lådsköldpaddor är en annan sorts sköldpadda som är sexuellt dimorf. Mogna manliga utsmyckade sköldpaddor har röda ögon medan kvinnliga ögon är bruna eller gula. Hanarna har också grönaktiga huvuden med röda eller orange benfjäll och honor har bruna huvuden med gula benfjäll.
