De flesta reptiler andas som människor gör:De andas in syre genom sina näsborrar eller munnar. Men vattenlevande sköldpaddor och vissa ormar kan också extrahera små mängder syre från vatten. Medan ormar vanligtvis kommer till ytan för att fylla på sina syreförråd, kan de absorbera lite syre från vattnet via huden. Sköldpaddor drar syre från vattnet via huden på halsen och kloakorna - kammaren genom vilken avföring, urater och ägg passerar.
De flesta reptiler är ektotermiska djur, vilket innebär att deras biologiska processer sker snabbare när djuren är varma och långsammare när djuren är svala. Det betyder att ju högre temperatur, desto mer syrereptiler kräver. Därför kan vissa ormar och sköldpaddor vid kalla temperaturer, som under vinterdvala, extrahera tillräckligt med syre ur vattnet för att tillgodose sina behov utan att behöva gå upp till ytan för luft.
